تم تطوير مركز جاكرتا الإسلامي بناءً على خطة رئيسية تتكون من ثلاثة مجمعات هي:
(1) مسجد يتسع لعدد مجتمعات إسلامية تصل إلى 20.680 شخصًا.
(2) مبنى التعليم والتدريب في مفهوم كلية المجتمع لمركز جاكرتا الإسلامي (CC JIC).
(3) مجمع أعمال يتألف من ثلاث وحدات أعمال وهي فندق وقاعة مؤتمرات ومبنى مكاتب.
